三峡库区珍稀濒危植物保护始于2003年，10年间累计投入745万元人民币，中国科学院武汉植物园、华中农业大学、武汉大学等科研院所及海外专家的参与抢救，已建成41公顷的珍稀濒危特有植物繁育区。其中，三峡库区特有植物26种3100株，分布于三峡库区175米淹没线以下，濒临灭绝的植物有“巫山类芦”、“宜昌黄杨”和“丰都车前”等。
三峡库区有“植物基因库”的美誉，在新生代第四纪冰期曾是古生物的“避难所”。目前，已知维管束植物5000余种，占中国维管束植物总数的16%。其中，属于国家重点保护的植物有桫椤、水杉、银杉、巴东木莲、鹅掌楸、水青树、伯乐树、香果树等155种。库区地处中国三大特有植物分布中心之一，荟萃了大量的中国特有属种。
三峡植物园负责人宋正江介绍称，为了让珍稀濒危植物扎根新家，技术人员通过采集植物原生地土壤，搭建“气候棚”等方式，恢复野生植物原有状态。如今，三峡植物园已通过模拟环境，繁育成功了疏花水柏枝、水杉、鹅掌楸、巴东木莲、伞花木等众多植物。
“已经建立的植物资源的数据库和信息系统，对形成了种质基因库，使三峡库区珍稀濒危植物真正转危为安具有重要的意义。”宋正江表示。
2003年6月，三峡工程蓄水后，受淹没影响的库区陆生珍稀植物多达500余种。目前，尚有大量的库区珍稀植物亟需保护，其中有的植物已经濒临灭绝。
